动物学家研究表明：所有毛皮动物•，包括藏獒在内的色型基因等位符号为BB、CC、HH、KK、PP、丌、W、WW、ZZ等9对等位基因。因此，在藏獒繁殖提纯复壮时，也离不开毛色等位基因符号。然而，在藏獒繁殖时只用人们喜欢的色型去繁殖我们需要的色型。如纯白CC、VV、黑色ZZ、青色TT、浅黄Vv、铁包金ZZ这6种色型。具体演变是由公、母犬的色型交配后所产的仔犬表现出来。
♦相同毛色正常文配
在配种时要注意掌握，防止出现杂色的色型。如红配白、黑配白等杂色被毛。为使后代犬毛色纯正、稳定，须用相同毛色的犬去进行交配，这样可少繁殖出杂毛色的幼犬。如用黑色公獒去配纯黑色母獒，用铁包金公獒去配铁包金母獒，用金公獒去配金母獒。
♦不同毛色改良文配
要想繁育出不同于种公犬或种母犬毛色的后代，在种犬毛色的搭配上一定要合适正确。否则，后代的毛色将花样杂乱，无一点欣赏与商品的价值，更会因后代毛色杂乱，对藏獒今后的毛色巩固带来很不利的后果。
A.繁育金红色或红棕色
可用纯正的公獒去配铁包金的母犬，因母犬本身体内存在有黄、红色素的基因，这样相配可能会产出金红色或红棕色的后代。但所繁殖出来的红毛后代，再次繁殖时，是不能去配那些也用此改良法产出的同毛色獒犬。因其红色显性基因不稳定，如果相配，结果可能出现红毛稀少，黑毛偏重，或红头黑背红腿或完全黑色的后代。
B.繁育白色
可用纯白色的公犬去配草的母犬(或用纯白色的母獒去配草的公犬)，这样就能产出一些白色的幼仔，但幼仔大多会在头顶、耳片上及尾巴中间带有明显的浅黄毛根。
C.繁育黑白相间的灰色
可用黄棕色的公獒(黄毛中夹有黑毛尖)去配纯黑色的母獒(或用黄棕色的母獒去配黑色公獒)，这样就可生出黑白混合的灰獒或浅黄带有黑毛，整体上显麻灰色的后代。
♦配种毛色上的择优去劣
为了让母犬所繁育出的后代毛色纯正，在选种公獒时一定要搭配正确，不能用双方都存在的同一缺陷犬去交配。这样交配，会使父母犬共同存在的缺点完全表现在后代犬只上。以下就是一些常见的择优淘劣选育方法：
a.尾巴尖白的母犬，用无此缺陷的公犬交配。
b.犬鼻梁有白斑的母犬，就用无此缺陷的公犬交配。
c.胸部白块过大的犬，可选用无此缺点的犬交配。
d.双腿有白毛的铁包金母犬，可选腿无白毛的纯正铁包金公犬交配。
e.铁包金犬的黄度较浅，就选用铁包金红色深的犬交配。
f.犬眼上方眉处2圆点无色或色浅，就选用圆点大和颜色亮的犬交配。
g.棕红色的獒，是由毛色不相同的父母犬所产出的犬，故应选择纯的犬去交配。
h.母犬的被毛中黑毛尖略重，可用纯正的公犬去交配。
i.铁包金的公犬或母犬，全身毛色都纯正，唯有犬的嘴巴唇腮两侧的黄度较浅，可选用嘴筒艳亮的犬去交配。
j.对黄头、黑背、黄腿的犬，首选纯正的铁包金犬去交配。k.对青灰色的犬，可用铁包金毛色的犬交配。